Après le passage d'une tempête en haute mer, de mystérieuses lueurs apparaissent dans l'eau près d'une plate-forme pétrolière. Peu de temps après, la découverte d'un virus inconnu force le responsable sanitaire de la côte à décréter l'état d'urgence. Éva, chercheuse, et Fin, biologiste marin, collaborent pour en déterminer l'origine.
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Menace En Eaux Troubles a été diffusé sur M6 le lundi 18 juin 2012, 15H40.